殺菌滅藻劑主要用于各行業的循環水系統中，具有廣譜、高效的殺菌滅藻能力，大家比較熟悉的產品是3Q-101殺菌滅藻劑。除此之外，常用的殺菌滅藻劑還有以下幾種：
　　1、季銨鹽類殺菌劑：十二烷基二甲基芐基氯化銨、十四烷基二甲基芐基氯化銨、聚季銨鹽等。
　　2、過氧化物殺菌劑：雙氧水、過氧乙酸等。
　　3、含氯殺菌劑：氯氣、二氧化氯、二氯異氰尿酸鈉(優氯凈)、三氯異氰尿酸鈉等。
　　4、唑啉類：異噻唑啉酮、苯并異噻唑啉酮等。
　　5、醛類：戊二醛等。
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